約翰福音裏雖然沒有用到『召會』這辭，卻有許多經節含示召會。例如：二章十六至二十二節、十四章二至三節中『父的家』，三章二十六至三十節中的『新婦』，十章十六節中『羊…成為一群』，十一章五十二節中『神…兒女，都聚集歸一』，十二章二十四節中『許多子粒』所隱含的『一餅』，十五章五節中的『葡萄樹』，十七章十一及二十一至二十二節中『使他們都成為一』，等。按照約翰福音，三一神作信徒生命的結果，乃是產生召會。
牧養乃是開啟約翰福音的鑰匙。約翰福音二十一章說到牧養，指明牧養是約翰福音的完成和總結。主在復活之後把使徒的職事與祂天上的職事合併，以照顧神的羊群，就是召會，結果帶進基督的身體（約二一15～17）。我們若不認識牧養是甚麼，整卷約翰福音對我們就是空洞的；惟有我們牧養別人時，我們纔能內在的認識約翰福音。
約翰福音十章十六節啟示，基督是好牧人，為羊捨命，使羊在神聖的生命裏成為一群，歸一個牧人。首先，祂捨了祂屬人的生命以成功救贖，使我們能有分於祂神聖的生命。在復活裏，主作為好牧人，以祂自己並在祂自己這草場上餧養我們，藉此牧養我們。今天，復活的基督這位賜生命的靈作了我們的草場。在日常的基督徒生活當中，我們應當體認，我們是在草場上享受基督作為豐富的生命供應。
主也在生命裏從裏面牧養我們。祂一直在神聖的生命裏帶領我們、引導我們並指引我們。活的基督是我們的牧者，不僅賜我們生命，祂就是我們的生命。基督是藉著作我們的生命並活在我們裏面以牧養我們；實際上，祂活在我們裏面，就是祂的牧養。
藉著基督這好牧人的牧養，我們眾人得以『成為一群，歸一個牧人』。『一群』表徵一個召會，基督的一個身體。這是主藉著祂的死，把祂永遠、神聖的生命分賜到眾肢體裏面所產生的。在祂的牧養之下，主已使猶太信徒和外邦信徒合為一群，一個召會，就是基督的身體。
約翰福音啟示生命與建造，生命是為建造，建造是本於生命（十一25，十四2）。我們需要看見，三一神正在將祂自己作為生命分賜到信徒裏面，以及信徒由於這分賜的結果，成為神的建造，就是祂的擴展、擴大、和團體的彰顯。特別在十四章二至三節指明，主耶穌在生命裏牧養我們乃是為著父的家，就是經過過程並終極完成之三一神與祂所救贖、重生、變化之選民神人二性的合併。
主耶穌在祂的復活裏更大的重建神的殿，使其成為團體的殿，就是基督奧祕的身體（約二19～22）。在十字架上被拆毀的耶穌身體，微小且軟弱；但在復活裏，基督的身體廣大且有能。自從祂復活那一天，主耶穌一直在復活的生命裏擴大祂的身體；祂仍然在復活的過程中，為著建造祂的身體作工。
父的家分為三個階段：神成肉體的階段；基督與祂的信徒一同復活，建造成為召會的階段；以及終極完成的階段，就是新耶路撒冷。主的來，將神帶到人裏面；祂的去，將人帶到神裏面；藉著這樣的來和去，祂將神建造到人裏面，並將人建造到神裏面，藉此建造神的家。主耶穌憑著那靈並藉著祂的死與復活，正在建造一個生機體，召會，就是祂的身體和父的家。父的家乃在於三一神經過成為肉體、釘十字架和復活，將祂自己作到信徒裏面，好與他們完全調和，使祂能把他們建造成一個生機體，作祂的居所和彰顯。
